Recherche
- 2008-2009: Poste d'Attaché Temporaire d'Enseignement et de Recherche (ATER) dans l'Equipe de Dynamique des Structures et Interactions des Macromolécules Biologiques (DSIMB) Inserm UMR-S 665, Paris.
- sujet: Modélisation dynamique des réseaux géniques de régulations transcriptionnelles impliqués dans la résistance aux antifongiques chez les levures, collaboratrice: Gaëlle Lelandais.
- Analyse de données transcriptomiques. Inférence de réseaux (méthode bayésienne).
- 2005-nov 2008: Thèse en Bioinformatique dans l'Equipe de Bioinformatique Génomique et Moléculaire, Inserm UMR-S 726, Paris.
- sujet: Rôle des transferts horizontaux dans l'évolution de la pathogénicité chez Mycobacterium tuberculosis, encadrant: Patrick Deschavanne.
- Développement de méthodes de détection des transferts horizontaux. Analyses statistiques multivariées. Encadrement de stagiaires et de techniciens.
- janvier-août 2005: Stage de master recherche dans l'Equipe de Bioinformatique Génomique et Moléculaire, Inserm UMR-S 726, Paris.
- sujet: Analyse et comparaison des génomes d'Escherichia coli, encadrant: Patrick Deschavanne.
- Eté 2003: Stage de recherche dans le laboratoire de Génomique des Microorganismes Pathogènes à l'Institut Pasteur.
- sujet: Analyse bioinformatique des sites génomiques de fixation de protéines régulatrices chez les bactéries pathogènes Streptococcus agalactiae et Photorhabdus luminescens, encadrant: Massimo Vergassola.
- Eté 2002: Stage de recherche dans l'équipe de modélisation moléculaire du Laboratoire de Biotechnologie et de Pharmacologie génétique Appliquée de ENS Cachan.
- sujet: Réalisation de cartes de potentiel électrostatique à la surface d'inhibiteurs potentiels de la mastocytose, en utilisant les réseaux neuronaux de Kohonen, encadrant: Marc Lebret.
Enseignement
- 2008-2009: ATER à l'Université Paris Diderot - Paris 7, 96h/an (voir enseignement).
- - 24h, Master 1&2 Biologie-Informatique, programmation en R et en python.
- - 20h, Licence 3 Biologie-Informatique, Modélisation des systèmes biologiques.
- - 20h, Licence 3 Biochimie, Programmation python pour la modélisation des systèmes biologiques.
- - 32h, Licence 2 SNV, Informatique pour Biologistes.
- 2005-2008: Monitorat à l'Université Paris Diderot - Paris 7, 65h/an (mêmes enseignements).
- 2004-2005: Interrogatrice orale en Sciences de la Vie et de la Terre en 2ème année de classe préparatoire BCPST au lycée Fénelon (Paris).
- mars - avril 2002: Stage Pédagogique en classe de 1ère STL au lycée de la Vallée de Chevreuse, Gif/Yvette (91).
Formation
- 2005-nov 2008: Doctorat de Biologie - Informatique en Analyse de Génomes et Modélisation Moléculaire, mention Très Honorable, Université Paris Diderot - Paris 7.
- 2001-2005: Magistère de Biotechnologies, Ecole Normale Supérieure de Cachan, département Biochimie Génie Biologique.
- - 2005: Master Biologie-Informatique, mention Bien, université Paris Diderot - Paris 7.
- - 2004: Agrégation Sciences de la Vie, de la Terre et de l'Univers, admise, rang 95/160, Université Paris Sud 11.
- - 2001-2003: licence - maîtrice de Biologie Cellulaire et Physiologie, mention Bien, Université Paris Sud 11.
- 1999-2001: classe préparatoire aux Grandes Ecoles de Biologie, Chimie, Physique et Sciences de la Terre, lycée Fénelon, Paris.
- 1999: baccalauréat scientifique, option mathématiques, mention Bien, Lycée Gérard de Nerval, Luzarches (95).
Compétences
- Bioinformatique: Analyse de données transcriptomiques, modèles bayesiens, analyses multivariées, modélisation mathématique appliquée aux systémes biologiques, alignements et comparaisons de génomes, phylogénies, gestion de base de données.
- Langages informatiques: C, Python, shell BASH, MySQL, R, php, HTML & CSS.
- Langues: Bilingue français - anglais, notions d'Allemand et d'Espagnol.
- Loisirs: Pratique en loisir de squash et de photographie argentique (Exposition été 2005 au Zango, 58 rue Daguerre Paris 14ème).
Autres expériences
- Mission de conseil : Stratégie d'exploitation de brevets pour les sociétés EMC3 et NEREIDES. Définition de la structure administrative. Spécification des besoins R&D.
- Association: création et présidente de l'association des anciens étudiants du master mention Biologie Informatique de l'Université Paris 7, de déc 2005 à déc 2007. Organisation d'un séminaire en bioinformatique. Organisation de tables rondes "débouchés". Crétion d'un site internet (AMBI).